MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-040

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017142	CAT	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384052409
2	NC_017142	TAA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384052409
3	NC_017142	TTTC	2	8	148	155	0 %	75 %	0 %	25 %	384052409
4	NC_017142	CAG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052409
5	NC_017142	TCCTTG	2	12	312	323	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384052409
6	NC_017142	TC	3	6	333	338	0 %	50 %	0 %	50 %	384052409
7	NC_017142	GAT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384052409
8	NC_017142	TGTGG	2	10	738	747	0 %	40 %	60 %	0 %	384052410
9	NC_017142	TCA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384052410
10	NC_017142	CAC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384052410
11	NC_017142	CAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052410
12	NC_017142	CATT	2	8	1070	1077	25 %	50 %	0 %	25 %	384052410
13	NC_017142	CGG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384052410
14	NC_017142	AGC	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052410
15	NC_017142	TTC	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384052410
16	NC_017142	ACA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384052410
17	NC_017142	AAG	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384052410
18	NC_017142	AGA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384052410
19	NC_017142	AGC	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052410
20	NC_017142	CAGG	2	8	1358	1365	25 %	0 %	50 %	25 %	384052410
21	NC_017142	GAACCG	2	12	1368	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052410
22	NC_017142	CAT	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384052410
23	NC_017142	GAA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384052410
24	NC_017142	GCC	2	6	1578	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384052410
25	NC_017142	CGC	2	6	1602	1607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384052410
26	NC_017142	GGC	2	6	1693	1698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384052410
27	NC_017142	GGAC	2	8	1702	1709	25 %	0 %	50 %	25 %	384052410
28	NC_017142	AGC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052410
29	NC_017142	GAG	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384052410
30	NC_017142	AGG	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384052410
31	NC_017142	TGA	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384052410
32	NC_017142	CAG	3	9	1804	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052410
33	NC_017142	AAG	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384052410
34	NC_017142	GGCCGA	2	12	1895	1906	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384052410
35	NC_017142	GAC	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384052410
36	NC_017142	AGG	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384052410
37	NC_017142	CT	3	6	1961	1966	0 %	50 %	0 %	50 %	384052410
38	NC_017142	GGAA	2	8	2035	2042	50 %	0 %	50 %	0 %	384052410
39	NC_017142	GGC	2	6	2090	2095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384052410
40	NC_017142	A	6	6	2130	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	384052410
41	NC_017142	GCCA	2	8	2144	2151	25 %	0 %	25 %	50 %	384052410
42	NC_017142	CGAGGG	2	12	2178	2189	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384052410
43	NC_017142	A	6	6	2397	2402	100 %	0 %	0 %	0 %	384052411
44	NC_017142	TGA	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384052411
45	NC_017142	AG	3	6	2759	2764	50 %	0 %	50 %	0 %	384052411
46	NC_017142	TGC	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384052411
47	NC_017142	GCT	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384052411
48	NC_017142	AGCC	2	8	2829	2836	25 %	0 %	25 %	50 %	384052411
49	NC_017142	CCA	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384052411
50	NC_017142	GGA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384052411
51	NC_017142	AT	3	6	2912	2917	50 %	50 %	0 %	0 %	384052411
52	NC_017142	ACC	2	6	2998	3003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384052411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.